• 免费服务热线
  • 400-065-6886
  • 电话:86(0)512-6295 9990
  • 传真:86(0)512-6295 9995
新闻中心

【昊工具】TCGA肿瘤数据库表达-甲基化联合挖掘神器又来了

发稿时间:2019-05-27来源:天昊生物


 

TCGA肿瘤数据库的挖掘工具不断推陈出新,最近小编又发现一个神器,好用又不失严谨和规范,快和小编一起来了解下吧!

数据库名称:Wanderer

数据库网址:http://maplab.imppc.org/wanderer/

数据库介绍:Wanderer是一个以基因为中心的交互式 web 查看器,可用于检索基因在TCGA数据库不同肿瘤类型中的DNA 甲基化和基因表达情况 (图片可下载,可用于发表)。

参考文章:Díez-Villanueva, Anna, Mallona I , Peinado M A . Wanderer, an interactive viewer to explore DNA methylation and gene expression data in human cancer[J]. Epigenetics & Chromatin, 2015, 8(1):22.

示例:检索PTEN基因在BRCA肿瘤中的甲基化和表达情况 (基因区域共65个甲基化探针)

  • 不同位置探针甲基化水平的可视化


 

  • 甲基化和表达量相关性的可视化

 


  •  甲基化和基因表达按统一模式呈现(图片来源于文章)


 

 

 

 

Copyright ? 2012-2018 香港真龙报(苏州)有限公司    All Rights Reserved   
XML 地图 | Sitemap 地图